重磅研究!世界首创高通量甲基化无创检测新技术,可用于癌症早筛
发布时间:2017-03-11 09:38 类别:医学前沿资讯 标签:通量 溯源 来源:未知
重磅研究!世界首创高通量甲基化无创检测新技术,可用于癌症早筛及溯源
作者:佚名 来源:测序中国 日期:2017-03-09
一周前,美国加州大学圣地亚哥分校张鹍教授刚在《Nature Methods》发表了评论性文章,就全球最新的单细胞分析方法做了点评。昨日,张鹍教授团队在《Nature Genetics》 上发布最新力作,世界首创高通量甲基化无创检测新技术,未来可以用于癌症无创早筛与溯源。
一周前,美国加州大学圣地亚哥分校张鹍教授刚在《Nature Methods》发表了评论性文章,就全球最新的单细胞分析方法做了点评。昨日,张鹍教授团队在《Nature Genetics》 上发布最新力作,世界首创高通量甲基化无创检测新技术,未来可以用于癌症无创早筛与溯源。
利用癌症标记物和组织特异性 CpG 甲基化模式的双重信号来检测和定位癌症
基于癌症患者体内的 ctDNA,可进行癌症的早期检测,但这些方法却不能追溯到肿瘤发生的位置。张鹍教授表示: 了解肿瘤的位置对有效的早期检测至关重要。
为了攻克这一问题,张鹍教授的团队开发出了一种新型液态活检技术,该技术不仅可以在癌症早期进行检测,而且能够实现组织定位。当癌症在身体中形成时,它与正常细胞竞争营养和空间,并导致正常细胞的死亡。而当正常细胞死亡时,它们将其 DNA 释放到血液中,因此研究者们可以通过这些 DNA 识别受影响的组织。
由于身体中的每个组织都有其独特的甲基化形式,所以可以根据该特性来对组织进行定位。在该新方法中,组织的定位是通过筛查 CpG 甲基化单倍型(CpG methylation haplotypes)标签实现的。
张鹍教授说: 我们偶然发现了这个方法。最初,我们采用常规方法,只想寻找癌细胞信号,并试图找出它们来自哪里。但是在该过程中我们还发现了来自其他细胞的信号,并意识到如果将两组信号整合在一起,实际上就可以确定癌症是否存在及其生长的位置。
在研发过程中,首先研究人员搭建了 10 个不同组织(肝脏、小肠、结肠、肺、脑、肾、胰腺、脾、胃和血液)全部 CpG 甲基化模式的数据库。他们还分析了来自 UCSD Moores 癌症中心的癌症患者的肿瘤样品和血液样品,并搭建了一个癌症特异性基因标记物的数据库。
接下来,研究者们筛查了癌症患者和健康人的血液样本,寻找癌症标记物和组织特异性 CpG 甲基化模式的双重信号。该检测的工作方式类似于双重身份验证过程 在统计截点之上寻找到两种信号,则表明是一个阳性结果。
张鹍教授强调: 这是一项概念验证性研究。为了将这项研究推向临床阶段,我们需要与医生合作,进一步优化和完善这种方法。
张鹍教授的这项研究无疑具有突破性的意义。肿瘤 ctDNA 液体活检与甲基化检测的全新组合,会重新修改我们对 肿瘤早筛 这一概念的认识,相关的产业前景也令人激动。据张鹍教授介绍,在该项研究中开发的 全新高通量甲基化无创检测技术 已经申请全球专利,并独家授权给他参与创建的公司 鹍远基因,以用于商业开发新的癌症早期检测。也许在不久的将来,全球 下一个 实力派癌症早筛公司就会因此产生,与此同时,这项新的技术能够帮助更多的人在早期发现癌症,并得到及时的治疗。
参考文献:
Shicheng Guo, Dinh Diep, Nongluk Plongthongkum, Ho-Lim Fung, Kang Zhang and Kun Zhang. Identification of methylation haplotype blocks aids in deconvolution of heterogeneous tissue samples and tumor tissue-of-origin mapping from plasma DNA. doi:10.1038/ng.3805