发布时间:2014-07-31 19:20 类别:医学前沿资讯 标签:病毒 肥胖 糖尿病 样本 发现 噬菌体 crAssphage 来源:医脉通综合
最近一项研究发现,一种未知病毒与肥胖和糖尿病相关,这种病毒被称为crAssphage,它会感染肠道里面最常见的拟杆菌。在研究人员偶然发现这种病毒后进行了人群检测,结果显示超过一半的人体内都有这种病毒。该研究结果发表在《自然通讯》杂志上。(Nat Commun 2014 Jul 24;5:4498)
crAssphag病毒的DNA碱基对大约是艾滋病病毒的10倍
美国圣地亚哥州立大学的生物信息学教授Robert Edwards及其同事在一次偶然情况下发现了这种病毒,并拟用先前肠道病毒的研究结果来研究这一新型病毒。从12名个体的粪便提取的DNA样本中,研究人员注意到所有的样本都有一群特殊的滤过性毒菌DNA,后者大约有9.7万对碱基对。但当他们进一步检验这种病毒的时候,发现没有已知的病毒DNA能与其配对。随后他们在国家健康研究所人类微生物组计划(HMP)的数据库以及美国阿贡国家实验室MG-RAST数据库里筛选这种病毒,结果发现它们在人类粪便里的样本里大量存在。
为了证明他们从电脑数据里发现的滤过性毒菌DNA在自然界的确存在,圣地亚哥州立大学的病毒学家John Mokili利用DNA扩增在国家健康研究所数据库的原始样本里找到了这种病毒。Mokili说:“这样我们才有生物证据证明他们在电脑里面发现的病毒确实存在于样本中。取样的人有一半人体内有这种新型病毒,但科学家们却对它一无所知。”
这种病毒的广泛存在它不是新出现的病毒。Edwards还说:“在我们所检测过的每个人体内,都有这种病毒的存在。目前我们能说的是,这种病毒和人类出现的时间一样长。”鉴于他们发现这种病毒所用的软件名为cross-assembly,他们给这种病毒命名为crAssphage。
crAssphage的DNA里的某些蛋白质类似于其它已知病毒的蛋白质。这使得爱德华兹的研究小组可以确定他们发现的新型病毒是一种噬菌体,它会在细菌内部感染和复制,通过利用创新性生物信息学技术,研究人员能够预测这种噬菌体会通过感染一种常见的内脏细菌——拟杆菌门而增值扩散。拟杆菌门生活在人体肠道末端,它们疑似在肠道细菌和肥胖症之间的联系起着重要作用。而crAssphage在这一过程中所起的作用将是未来研究的一个重点。
有关crAssphage的更多细节目前很难获得。这种病毒是如何传播的目前还是未知,它并不出现在新生婴儿的粪便样本里表明种这种病毒并不是母婴传播的,而是在童年时期感染上的。滤过性毒菌DNA的组成成分表明它是圆形结构,进一步的实验工作也证实病毒DNA是单一实体,但很难将其分离。
Edwards说:“我们知道它在这里,但是我们无法得到它。”如果可以将病毒单独分离出来,Edwards希望能进一步研究这种病毒在肥胖中的作用。这种病毒或可能从某种程度上调节了拟杆菌门的活动,但crAssphage究竟促进还是抑制了内脏里与糖尿病有关的过程,目前仍有待观察。
Edwards期待有一天能根据这种病毒来进行个性化用药。他说:“这可能是个性化噬菌体医学的关键。我们将人体内特殊的病毒毒株分离出来,接着利用噬菌体杀灭病菌,最终将它还给了你。”
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